孤獨癥的發(fā)病原因，至今仍是一個(gè)尚未完全解開(kāi)的謎。眾多學(xué)者認為孤獨癥是一種多病因的復雜神經(jīng)發(fā)育性疾病，其中大量研究顯示孤獨癥是先天性的，其病因最有可能是和人體內的基因有關(guān)，這個(gè)出了問(wèn)題的基因可能是來(lái)自家族性的、也可能在胚胎發(fā)育過(guò)程中因為環(huán)境因素導致的新突變。而且有時(shí)還不是一個(gè)基因出了問(wèn)題，有可能是好幾個(gè)基因都出了小小的問(wèn)題，這些小小問(wèn)題基因湊在一起可能構成了大腦發(fā)育的一個(gè)大問(wèn)題，最終導致孩子出現孤獨癥癥狀。

　　在孤獨癥病因的問(wèn)題上，需要澄清三大誤區：

　　★冰箱理論即以為孤獨癥兒是因為父母教養不當造成的。現已證實(shí)孤獨癥這個(gè)疾病的發(fā)生和家庭教養是沒(méi)有關(guān)系。家有孤獨癥孩子的父母家人已經(jīng)很痛心疾首了，如果再因錯誤的觀(guān)點(diǎn)，指責父母和家人，會(huì )給這些家庭帶來(lái)更沉重的心理負擔。

　　★疫苗學(xué)說(shuō)認為孤獨癥的發(fā)病和打預防針有關(guān)。這個(gè)學(xué)說(shuō)經(jīng)過(guò)大量的科學(xué)調查研究被證明也是錯誤的，孤獨癥的發(fā)病和打預防針沒(méi)有關(guān)系。

　　★其他如汞中毒學(xué)說(shuō)等等，到目前為止，大多數的科學(xué)研究也不支持這個(gè)學(xué)說(shuō)，也沒(méi)有得到明確的科學(xué)依據。