一般而言，亞斯柏格癥兒童和高功能自閉癥兒童的差異性很小，通常被稱(chēng)為自閉癥的延續或是變異的自閉癥。因此，有些亞斯柏格癥兒童，也常被誤認為是自閉癥，但其和自閉癥之間仍存在著(zhù)差異性，以下提供了幾點(diǎn)比較：

　　語(yǔ)文智商分面：

　　一般在定義亞斯柏格癥和高功能自閉癥，通常以智商七十以上來(lái)作為范圍。一九九八年，調查三百三十個(gè)個(gè)案研究中發(fā)現，高功能自閉癥兒童在語(yǔ)文智商方面，普遍低於亞斯柏格癥兒童。

　　高功能自閉癥兒童語(yǔ)文智商平均為七十七，亞斯柏格癥兒童則為九十八；在操作智商方面，亞斯柏格癥兒童為九十，高功能自閉癥兒童為八十六。研究結論顯示，語(yǔ)文智商是可以做為診斷亞斯柏格癥兒童和高功能自閉癥兒童的標準。

　　自閉癥兒童對於某些事情大多有特殊的興趣或特殊的天賦，例如機械性計數的能力、機械性音樂(lè )的能力、機械性的判斷能力，比較不屬於思考性能力；而亞斯柏格癥兒童則不同，亞斯柏格癥兒童可能一直會(huì )思考諸如「美國應該有一州是沒(méi)有空氣的」等思考性問(wèn)題。相對於高功能自閉癥所特有的機械性特殊能力，亞斯柏格癥兒童在特殊能力方面則屬思考性的。

　　語(yǔ)文流暢度方面：

　　在語(yǔ)文流暢度方面，亞斯柏格癥兒童沒(méi)有困難，兩歲前即會(huì )出現單字，三歲就會(huì )說(shuō)整個(gè)句子，但在四歲前，「你」、「我」、「他」等稱(chēng)謂還是會(huì )混淆，而且容易會(huì )有反覆和重覆對方話(huà)語(yǔ)的情況。亞斯柏格癥和高功能自閉癥最大的差異在於，高功能自閉癥的自發(fā)性語(yǔ)言非常少，不會(huì )流暢的表達；亞斯柏格癥兒童則在自發(fā)性語(yǔ)言和對談上并沒(méi)有問(wèn)題。問(wèn)題則在於對談時(shí)，亞斯柏格癥兒童會(huì )有「冗長(cháng)的對談」，不管對方有沒(méi)有興趣，會(huì )和對話(huà)者一直談同一件事情（例如他自己感興趣的事）容易引起對方的反感，進(jìn)而影響到其人際關(guān)系的互動(dòng)。

　　動(dòng)作協(xié)調方面：

　　在動(dòng)作方面，高功能自閉癥兒童的大肌肉動(dòng)作沒(méi)有問(wèn)題，亞斯柏格癥兒童則動(dòng)作顯的非常笨拙，他們一般的動(dòng)作協(xié)調困難有四項：

　　1.模仿肢體動(dòng)作有困難。

　　2.無(wú)法順利的接球。

　　3.單腳站立有困難。

　　4.兩手無(wú)名指彎曲有困難。

　　社會(huì )互動(dòng)方面：

　　在社會(huì )互動(dòng)能力方面，和自閉癥兒童不同的是，亞斯伯格癥兒童是具有能力、有興趣，且會(huì )去參與，但因為他的社會(huì )直覺(jué)和一般人有差異，所以無(wú)法了解人際互動(dòng)的意義。例如請他舉右手，他會(huì )舉左手，原因是他面對著(zhù)施令者，會(huì )以模仿的方式，跟著(zhù)施令者舉相同的手。所以在教導亞斯柏格癥兒童時(shí)，應注意其「參考點(diǎn)」的問(wèn)題，以教寫(xiě)字為例，不要面對著(zhù)他寫(xiě)，而是到他身旁教導他，以免寫(xiě)出來(lái)的字左右上下相反。

　　攻擊以及暴力行為方面：

　　亞斯柏格癥兒童因有滿(mǎn)高的道德標準，因此也容易會(huì )引發(fā)互動(dòng)上的沖突。例如過(guò)馬路時(shí)，看到有人闖紅燈，他們會(huì )馬上義正嚴詞的制止：「不行，叫警察來(lái)抓你喔！」。像是發(fā)生類(lèi)似的情況，就很容易和其他人發(fā)生沖突，而被誤解有攻擊暴力行為。有時(shí)候，他們只是因為被「逼急」了，才會(huì )產(chǎn)生攻擊或暴力行為。